张家口市疾病预防控制中心的前身为市卫生防疫站，于2005年1月6日拆分成市疾病预防控制中心，2006年1月迁入新建的疾控大楼，总建筑面积5880平方米。中心现有14个业务科室和5个行政科室。是同级政府举办的实施疾病预防控制与公共卫生技术管理和服务的财政基本保证经费的公益事业单位。
张家口市疾控中心于2005年1月成立，核定事业编制92名，实有人数106人。截止2011年5月底中心在岗人员90人（男59人，女31人）。其中卫生专业技术人员62人，占68.9%；其他专业技术人员7人，占7.8%；工勤行政管理人员21人，占23.3%。
中心和地病所总建筑面积6980平方米（中心5880平方米），其中实验室用房2506平米，占总面积比例为35.9%。按职能划分，检验中心内设微生物实验室（包括常规微生物实验室、PCR二级生物安全实验室、病毒分离二级生物安全实验室、结核病实验室），理化实验室、临检与生化实验室、艾滋病筛查实验室
中心有容纳120人会议室1个，40人会议室1个，应急情况下可启动的70人会议室1个（地下室）。有可上网计算机37台，打印机21台，视屏会议系统1套，同时图书室、阅览室、档案室、职工食堂等辅助设施齐全。
中心大型检验设备主要有：原子吸收分光光度计、原子荧光光谱仪、气相色谱仪、岛津高效液相色谱仪、离子色谱仪、荧光定量PCR仪、多台酶标仪、生物安全柜。2009年由政府投资分别购置了实时荧光定量PCR仪、全自动核酸提取工作站和不间断电源各一套等。
另有工作用车7部，常低温冷库6座。